Además de los distintos sectores apostólicos de la provincia, existen tres secretariados que se ocupan de algunas misiones específicas, de distinto rango, que dependen directamente del provincial.

El Secretariado de Misiones se ubica en la Curia de la Provincia de España, en Madrid. Su función institucional es doble: por una parte, la coordinación y acompañamiento de los Secretariados de Misiones de las antiguas Provincias (Secretariado de Misiones en Valencia, Misión del Japón en Madrid, Missió i Desenvolupament en Barcelona, Misioneros de Extremo Oriente en Palencia) y, por otra, la organización de la gestión de los proyectos de Misiones que realizaba antes la mesa de Provinciales con el Provincial de España.

La nueva Oficina debe ayudar, desde la Curia Provincial, en todas aquellas cuestiones relativas a las Misiones de la Provincia de España como, por ejemplo, las estancias de los jesuitas misioneros por aquí, la atención a personas donantes y bienhechores, la recepción de peticiones de ayuda, y otras gestiones de esta índole. El Secretariado intenta también dar respuesta a instituciones que no son las ONG, y apoya peticiones de colaboración económica con el Área de Cooperación Internacional del Sector del Apostolado Social de la Provincia de España.

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La misión compartida es una realidad y, al mismo tiempo, como tantas dinámicas del Espíritu y del Reino, está por hacer. La función de este secretariado es reflexionar, discernir y proponer caminos de futuro en este ámbito, atendiendo a dos dimensiones: por una parte, la misión compartida es sobre todo vida; pensar en cómo vivir juntos esa vida y generar procesos que la hagan fecunda; por otra parte, toda vida del Espíritu debe ser iluminada a partir del valioso aporte de una reflexión más teórica; pensar juntos, a la luz de las fuentes del Evangelio, la teología, las Congregaciones Generales y la reflexión que otras congregaciones religiosas están realizando en el marco de la Confer, cómo debemos avanzar en este camino de la comunión en la misión.

En definitiva, la función del secretariado es ayudar a pensar y ayudar a vivir la misión compartida con otros actores eclesiales, religiosos y laicos. Y así ayudar a la misión, la comunión y la unidad.

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Se ocupa de la estrategia comunicativa de la Compañía de Jesús, de la comunicación interna de la provincia en España, y de la relación con los medios para cuestiones que afectan a la Compañía de Jesús. Ya sea asesorando y apoyando instituciones concretas en distintos momentos, o liderando la comunicación en algunas situaciones que puedan requerirlo.

El secretariado se ubica en la oficina de comunicación de la provincia en Maldonado, donde está parte del equipo que apoya su labor, aunque varios de sus colaboradores lo hacen desde distintos lugares de la provincia.

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